消泡剂不是溶解在体系中，而是分散在体系中，所以消泡剂是否能均匀分散在体系中就显得尤为重要。当消泡剂均匀分散在体系中，对体系的透明度影响很小，且消泡剂能较长时间的团聚成大颗粒，这样就能在体系中保持相当长的时间。
产生泡沫的体系当消泡剂不能均匀分散在体系中，而是以很多小颗粒团聚在一起的话，一方面会影响体系的透明度，另一方面会使消泡剂团聚成大颗粒的时间变短，这就会造成消泡剂添加到体系中浑浊，隔天漂油。消泡剂用水稀释之后再添加效果会好一些。
2、消泡剂浑浊的问题
消泡剂不是以溶解的状态存在于体系中的，一般是悬浮在体系中，因此选用的疏水颗粒、硅油、疏水颗粒的用量和成色就至关重要，这样造成了消泡剂的性能千差万别，但是只要消泡效果好、抑泡时间长就没有多大问题。
3、消泡剂抑泡时间的问题
消泡剂中硅油的性质决定了消泡剂的抑泡时间。硅油含量的多少决定了消泡剂在体系中的使用时间长短。消泡剂粒径的大小决定了消泡剂的耐过滤性，粒径太大或者消泡剂搅拌不够充分都有可能导致消泡剂被过滤掉，污水处理中一般用的污水处理消泡剂就会经过很多次过滤，如果在过滤中将消泡剂过滤走，这样对消泡和抑泡都会产生影响。
4、消泡剂的失效问题
酸碱稳定性问题，如果消泡的耐酸碱性不好导致硅油分解，从而导致消泡剂失效；某些化学成分使硅油溶解到体系中，这样消泡剂不再有消泡的作用，而是作为一个表面活性剂存在体系中，体系的泡沫会比没加消泡剂的时候更多。
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